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- 第1章被改变的剧情（一）
- 第2章被改变的剧情（二）
- 第3章被改变的剧情（三）
- 第4章被改变的剧情（四）
- 第5章被改变的剧情（五）
- 第6章塞蕾娜到来，从真新镇出发的三人组
- 第7章与小霞的邂逅，小智与凤王的约定（上）
- 第8章与小霞的邂逅，小智与凤王的约定（下）
- 第9章抵达常磐市，初遇火箭队（笨蛋）流星三人组
- 第10章小蜻与皮卡丘的对决。意外出现！皮卡丘的电系绝招对地面系有用！？
- 第11章在常磐森林与火箭队（笨蛋）流星三人组的第一次对决
- 第12章初遇小黄，帮小黄收服时拉比
- 第13章认了小黄做妹妹。与伙伴们相约在蓝普尔其
- 第14章小智和小修的第一场道馆战，实力强劲的小刚（一）
- 第15章小智和小修的第一场道馆战，实力强劲的小刚（二）
- 第16章小智和小修的第一场道馆战，实力强劲的小刚（三）
- 第17章与小蓝的相遇，再遇火箭队（笨蛋）流星三人组
- 第18章皮卡丘的爱情。华蓝市的水中花
- 第19章双打！？Mega暴鲤龙VS比雕*2
- 第20章在枯叶市与火箭队（笨蛋）流星三人组再次相遇
- 第21章皮卡丘暴走
- 第22章圣安奴号大作战（上）
- 第23章圣安奴号大作战（下）
- 第24章拯救小修行动开始！
- 第25章赐予之力的两大用法：强化四大力量和与神奇宝贝，合体！？
- 第26章与神奇宝贝的第一次合体，小修变成了美少女！？
- 第27章超巨大毒刺水母登场，凤王现世
- 第28章小黄要当医生
- 第29章再次双打，超能之力VS波导之力，娜姿、小蓝VS小智、小修
- 第30章重归于好，小智的战术
- 第31章夺得金黄徽章，初遇坂木
- 第32章害羞的女版小智
- 第33章摧毁火箭队秘密指挥部（上）
- 第34章摧毁火箭队秘密指挥部（中）
- 第35章摧毁火箭队秘密指挥部（下）
- 第36章小蜻悲惨的过去，小修喜当爹，小智喜当娘
- 第37章大特训
- 第38章实力升华，得到粉红徽章
- 第39章野生原野区大乌龙
- 第40章黑暗市的道馆纠纷
- 第41章大傻谷的化石之战（上）
- 第42章大傻谷的化石之战（下）
- 第43章参加考试，超梦惊现！（上）
- 第44章参加考试，超梦惊现！（下）
- 第45章火之红莲与水之华蓝（一）
- 第46章火之红莲与水之华蓝（二）
- 第47章火之红莲与水之华蓝（三）
- 第48章火之红莲与水之华蓝（四）
- 第49章火之红莲与水之华蓝（五）
- 第50章1对3，坂木大战真新镇三剑客（上）
- 第51章1对3，坂木大战真新镇三剑客（下）
- 第52章超梦事件（一）
- 第53章超梦事件（二）
- 第54章超梦事件（三）
- 第55章超梦事件（四）
- 第56章超梦事件（五）
- 第57章与四天王希巴的战斗
- 第58章超古代神奇宝贝复活，其真面目竟然是······
- 第59章石英大会开幕式
- 第60章来自阿罗拉的劲敌和神秘的选手
- 第61章凌驾于传说神奇宝贝之上的人类诞生了
- 第62章初战
- 第63章阿罗拉形态的神奇宝贝
- 第64章神兽公主塞蕾娜
- 第65章八强，小智VS安（上）
- 第66章八强，小智VS安（中）
- 第67章八强，小智VS安（下）
- 第6章巧遇阿弘，与科拿的战斗（下）
- 第7章前去挑战卡那兹道馆
